L’Association est administrée par un conseil d’administration composé de 21 membres : 18 membres actifs et 3 membres associés, qui se réunit régulièrement et plusieurs fois par an en séance ordinaire. Cette instance de gouvernance est garante de la cohérence des orientations annuelles avec le Projet Régional d’Action et de Développement (PRAD).
Le Conseil d’Administration établit les tendances budgétaires de l’année suivante, il vote le budget et s'assure du suivi financier de l’Association. 
Il peut être saisi des questions concernant les relations avec les autorités de tutelle, les pouvoirs publics, les grandes organisations ; des questions qui touchent particulièrement au financement et au patrimoine de l’Association et celles mettant en jeu sa responsabilité juridique de personne morale.

Le Conseil d’administration peut ouvrir ses instances aux membres afin d'entendre éventuellement toute personne dont il juge opportun de recueillir l’avis.